斑点杂交实验
【实验原理】用的高辛标记的HCV RNA探针检测HCV RT-PCR产物。
【实验步骤】
1.处理:将尼龙膜浸泡于20×SSC 中吸足液体后,夹在两层滤纸中37℃烘烤20—30 min。(将尼龙膜置入烤箱后立即进行下一步操作)
2.变性:将待测DNA 样品(HCV 经RT-PCR 扩增产物;HBV 的PCR 扩增产物作为阴性对照,每组两种样品各10μL )置于PCR 仪中100℃加热10min ,立即置冰中,并置于-20℃冰箱中骤冷5min 。
(每一排共三组的样品点在同一张尼龙膜上)
【原理】 使DNA 样品变性,即双链DNA →单链DNA 。
3.点样:将上述变性后的样品各2μL 点在尼龙膜的毛面上,室温下风干后,于烤箱中120℃烘烤30 min。
【原理】 使样品中的DNA 与膜结合牢固。
4.预杂交:将杂交膜封入杂交袋中(每两组的膜背靠背封在一个杂交袋中),做好剪角标记(勿过大)。用1000μL 加样器,加入预杂交液(Dig Easy Hyb),每组5mL 全部加完,使尼龙膜恰恰漂起即可,若5mL 预杂交液不足,可适当补加。除去气泡,置42℃恒温摇床上,轻轻振摇30min-60min 。
【原理】 封闭杂交膜上多余的非特异性DNA 结合位点。
5.杂交液制备:用预杂交液将探针按100ng/mL浓度稀释,即为杂交液。 (已准备好)
6.杂交:剪开杂交袋一个小角,倾去预杂交液,加入杂交液2-3mL ,除去气泡,封口。置50℃恒温摇床上,轻轻振荡过夜。
7.洗膜:(1)回收杂交液;
(2)室温下,用2×wash solution洗膜两次,每次5min ;
(3)将0.1×wash solution预热到50℃洗膜两次,每次15min 。
【原理】洗去未结合的探针,否则会导致过高的本底。
8. 封闭:取出膜,在含有30mL BufferⅠ的培养皿中浸泡1分钟平衡后,转入30mL BufferⅡ中,室温作用30-60min 。
【原理】封闭杂交膜上非特异性的蛋白结合位点。
(在此阶段末期,准备下一步的抗体稀释。稀释方法:加1μL Anti-DIG-AP到10mL Buffer Ⅱ后轻轻混匀,4℃ 可保存12h 。)
9. 酶联抗体结合:将杂交膜封入一个新的杂交袋中,加入3mL Anti-DIG-AP/ Buffer Ⅱ中室温作用30min ,经常摇动,使酶联抗体与地高辛结合。
10. 洗膜:(1)取出膜,将膜放入含有30mL BufferⅠ的培养皿中,洗膜两次,
每次15min 。
【原理】洗去未结合的酶联抗体。
(2)取出膜,将膜放入含有20mL BufferⅢ的培养皿中平衡2min 。
11.显色:(1)将45μL NBT solution和35μL X-Phosphate加入到10mL Buffer
Ⅲ中,显色液必需现配现用!
(2)在10mL 新鲜制备的显色底物液中静止避光显色数小时,常在12h 内完成显色反应。
斑点杂交实验
【实验原理】用的高辛标记的HCV RNA探针检测HCV RT-PCR产物。
【实验步骤】
1.处理:将尼龙膜浸泡于20×SSC 中吸足液体后,夹在两层滤纸中37℃烘烤20—30 min。(将尼龙膜置入烤箱后立即进行下一步操作)
2.变性:将待测DNA 样品(HCV 经RT-PCR 扩增产物;HBV 的PCR 扩增产物作为阴性对照,每组两种样品各10μL )置于PCR 仪中100℃加热10min ,立即置冰中,并置于-20℃冰箱中骤冷5min 。
(每一排共三组的样品点在同一张尼龙膜上)
【原理】 使DNA 样品变性,即双链DNA →单链DNA 。
3.点样:将上述变性后的样品各2μL 点在尼龙膜的毛面上,室温下风干后,于烤箱中120℃烘烤30 min。
【原理】 使样品中的DNA 与膜结合牢固。
4.预杂交:将杂交膜封入杂交袋中(每两组的膜背靠背封在一个杂交袋中),做好剪角标记(勿过大)。用1000μL 加样器,加入预杂交液(Dig Easy Hyb),每组5mL 全部加完,使尼龙膜恰恰漂起即可,若5mL 预杂交液不足,可适当补加。除去气泡,置42℃恒温摇床上,轻轻振摇30min-60min 。
【原理】 封闭杂交膜上多余的非特异性DNA 结合位点。
5.杂交液制备:用预杂交液将探针按100ng/mL浓度稀释,即为杂交液。 (已准备好)
6.杂交:剪开杂交袋一个小角,倾去预杂交液,加入杂交液2-3mL ,除去气泡,封口。置50℃恒温摇床上,轻轻振荡过夜。
7.洗膜:(1)回收杂交液;
(2)室温下,用2×wash solution洗膜两次,每次5min ;
(3)将0.1×wash solution预热到50℃洗膜两次,每次15min 。
【原理】洗去未结合的探针,否则会导致过高的本底。
8. 封闭:取出膜,在含有30mL BufferⅠ的培养皿中浸泡1分钟平衡后,转入30mL BufferⅡ中,室温作用30-60min 。
【原理】封闭杂交膜上非特异性的蛋白结合位点。
(在此阶段末期,准备下一步的抗体稀释。稀释方法:加1μL Anti-DIG-AP到10mL Buffer Ⅱ后轻轻混匀,4℃ 可保存12h 。)
9. 酶联抗体结合:将杂交膜封入一个新的杂交袋中,加入3mL Anti-DIG-AP/ Buffer Ⅱ中室温作用30min ,经常摇动,使酶联抗体与地高辛结合。
10. 洗膜:(1)取出膜,将膜放入含有30mL BufferⅠ的培养皿中,洗膜两次,
每次15min 。
【原理】洗去未结合的酶联抗体。
(2)取出膜,将膜放入含有20mL BufferⅢ的培养皿中平衡2min 。
11.显色:(1)将45μL NBT solution和35μL X-Phosphate加入到10mL Buffer
Ⅲ中,显色液必需现配现用!
(2)在10mL 新鲜制备的显色底物液中静止避光显色数小时,常在12h 内完成显色反应。