腘窝囊肿的鉴别诊断
1．半月板囊肿：少数半月板囊肿可在离半月板相当远的部份出现．源于内侧半月板的囊肿，通常要比源于外侧者大些．患内侧半月板囊肿时，做屈膝动作，由于膝内侧腘韧带的压力，可使其自膝内侧消失，自腘窝部显示出来。
2．膝部腱鞘囊肿：系一些硬度相同的软组织肿块，此种肿块易与脂肪瘤相混淆．病因不明。
3．胭窝动脉瘤：腘窝包块，应想到此病的可能性．腘窝动脉瘤并非罕见，但常被漏诊。由于膝关节退变可并发腘窝囊肿，动脉硬化症可并发动脉瘤，二者均发生在同一年龄组；此外，腘窝动脉瘤和胭窝囊肿相似，常呈对称性且均无明显症状，因此二者很易混淆．有腘窝囊肿时，胭窝动脉被囊肿遮盖．不易扪得．如腘窝部大范围内能扪得与脉搏一致的搏动，可能患有动脉瘤．此外，若发现震颤与杂音，更可加强动脉瘤的诊断．但如动脉瘤的囊腔已栓塞，此两项体征则难以发现。
4．腘窝动脉囊性变：这种病的病因尚不清楚，被认为是与动脉粥样硬化无关的动脉外膜粘液性退变．加于胭动脉的反复轻度损伤，可能是其原因．因病变靠近膝关节，关节的经常运动，可能是造成损伤的因素．起病可缓慢也可突然．运动时足变冷而苍白．本病的一个特点是肿块并不经常存在．肿块仅是偶而被发现，这一点有助于避免误诊．
5．孤立性外生骨疣：从股骨三角区可以长出外生骨疣，同时伴有一个滑囊．此骨疣与上述腘窝动脉瘤常有一定联系．骨疣是否存在，摄X 线片检查可以证实或排除．
6．腘窝静脉曲张：膝关节做快速地屈伸运动，胭窝部出现肿块，除囊肿外，还可能是一团曲张的静脉，这常是腘窝部探查手术阴性时的另一个发现。
7．半膜肌断裂或肥大：腘窝肿块可以是单侧半膜肌断裂或双侧半膜肌局限性肥大．这种肿块的特征是：令屈膝肌肉收缩对抗阻力，肿块体积增大．本病如在全麻下施行探查手术，可无阳性发现．
8．股二头肌腱囊肿及起自膪外侧神经的囊肿：前者的位置低，后者可伴有神经麻痹．此二者还可误诊为外侧半月板囊肿．
腘窝囊肿的鉴别诊断
1．半月板囊肿：少数半月板囊肿可在离半月板相当远的部份出现．源于内侧半月板的囊肿，通常要比源于外侧者大些．患内侧半月板囊肿时，做屈膝动作，由于膝内侧腘韧带的压力，可使其自膝内侧消失，自腘窝部显示出来。
2．膝部腱鞘囊肿：系一些硬度相同的软组织肿块，此种肿块易与脂肪瘤相混淆．病因不明。
3．胭窝动脉瘤：腘窝包块，应想到此病的可能性．腘窝动脉瘤并非罕见，但常被漏诊。由于膝关节退变可并发腘窝囊肿，动脉硬化症可并发动脉瘤，二者均发生在同一年龄组；此外，腘窝动脉瘤和胭窝囊肿相似，常呈对称性且均无明显症状，因此二者很易混淆．有腘窝囊肿时，胭窝动脉被囊肿遮盖．不易扪得．如腘窝部大范围内能扪得与脉搏一致的搏动，可能患有动脉瘤．此外，若发现震颤与杂音，更可加强动脉瘤的诊断．但如动脉瘤的囊腔已栓塞，此两项体征则难以发现。
4．腘窝动脉囊性变：这种病的病因尚不清楚，被认为是与动脉粥样硬化无关的动脉外膜粘液性退变．加于胭动脉的反复轻度损伤，可能是其原因．因病变靠近膝关节，关节的经常运动，可能是造成损伤的因素．起病可缓慢也可突然．运动时足变冷而苍白．本病的一个特点是肿块并不经常存在．肿块仅是偶而被发现，这一点有助于避免误诊．
5．孤立性外生骨疣：从股骨三角区可以长出外生骨疣，同时伴有一个滑囊．此骨疣与上述腘窝动脉瘤常有一定联系．骨疣是否存在，摄X 线片检查可以证实或排除．
6．腘窝静脉曲张：膝关节做快速地屈伸运动，胭窝部出现肿块，除囊肿外，还可能是一团曲张的静脉，这常是腘窝部探查手术阴性时的另一个发现。
7．半膜肌断裂或肥大：腘窝肿块可以是单侧半膜肌断裂或双侧半膜肌局限性肥大．这种肿块的特征是：令屈膝肌肉收缩对抗阻力，肿块体积增大．本病如在全麻下施行探查手术，可无阳性发现．
8．股二头肌腱囊肿及起自膪外侧神经的囊肿：前者的位置低，后者可伴有神经麻痹．此二者还可误诊为外侧半月板囊肿．