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一、辅导期内应注意的几个问题：
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1、 辅导期的一般纳税人的纳税辅导期一般为6个月，到期后纳税人应主动向主管税务机关提交转为正式一般纳税人的申请。应在辅导期最后一个月完成申报后，向大厅综合受理窗口提出申请。
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2、 专用发票的领购数量。辅导期一般纳税人每次增值税防伪税控专用发票的领购量最多不得超过25份，发票不够增加数量的应先依据上一次领购并开具的正数专用发票上注明的销售额按4%征收率计算 ，向主管税务机关预缴税款。此预缴税款在次月申报时一定要填写在申报表主表的28栏“分次预缴税款”中，否则当月和以后月份，将无法使用此预缴来抵缴税款。
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3、 专用发票的填开限额。辅导期一般纳税人每张专用发票最高开票限额原则上不得超过一万元。
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4、 进项税额的抵扣。在辅导期内，商贸企业取得的专用发票抵扣联、海关进口增值税专用缴款书、废旧物资发票以及货物运输发票要在交叉稽核比对无误后，方可予以抵扣，未收到主管税务机关稽核比对结果通知书及其明细清单的不准许抵扣。
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5、 待抵扣进项税额的会计核算方法。在“应交税金”科目下增设“待抵扣进项税额”明细科目，核算己通过认证但暂时无法抵扣的专用发票抵扣联、海关进口增值税专用缴款书、废旧物资普通发票以及货物运输发票的进项税额。取得上述扣税凭证时，借记“应交税金——待抵扣进项税额”明细科目 ，贷记相关科目；交叉稽核比对无误允许抵扣后，借记“应交税金——应交增值税（进项税额）”专栏，贷记“应交税金——待抵扣进项税额”科目。经核实不得抵扣的进项税额，红字借记“应交税金——待抵扣进项税额”，红字贷记相关科目。取得需抵扣的铁路运输发票、航空运输发票、海洋运输发票和管道运输发票直接记入“应交税金——应交增值税（进项税额）”。
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6、 辅导期结束后第一个月，将“应交税金——待抵扣进项税额”可允许抵扣的部分（包括比对相符、核查准予抵扣、核查暂无结果）转入“应交税金——应交增值税（进项税额）”，并将数据填入增值税申报表附表二“申报抵扣的进项税额”相关栏次，与本月取得的进项税一并申报抵扣。
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二、申报表的填写方法：
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1、 “稽核结果通知书”上允许抵扣进项税额的申报方法。辅导期一般纳税人在接到“稽核结果通知书”的当月（一定要填写在当月的进项税额中，当月不填写的的视同自行放弃），按以下要求填写《增值税纳税申报表附列资料（表二）》，并于纳税申报时申报抵扣；
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①第3栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符专用发票、协查结果中允许抵扣的专用发票的份数、金额、税额。
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②第5栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符海关完税凭证、协查结果中允许抵扣的海关完税凭证的份数、金额、税额。
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③第7栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符废旧物资普通发票、协查结果中允许抵扣的废旧物资普通发票的份数、金额、 税额。
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④第8栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符货物运输发票、协查结果中允许抵扣的货物运输发票的份数、金额、税额。
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⑤第23栏与第3栏填写的内容相同。
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⑥第24栏填写本月己认证相符但未收到稽核比对结果的防伪税控增值税专用发票数据。
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⑦第25栏、第35栏填写的内容与第24栏相同。
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⑧第28栏填写本月未收到稽核比对结果的海关完税凭证数据。
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⑨第30栏填写本月未收到稽核比对结果的废旧物资普通发票数据。
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⑩第31栏填写本月未收到稽核比对结果的货物运输发票数据。
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2、 待抵扣进项税额的申报方法。辅导期一般纳税人取得的专用发票抵扣联以及废旧物资普通发票和货物运输发票，要在收票当月及时到税务机关认证，海关进口增值税专用缴款书、及时录成清单（磁盘）上交主管税务机关参与比对，并将上述数据填写在《增值税纳税申报表附列资料（表二）》中“待抵扣进项税额”相关栏次内。
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《增值税纳税申报表附列资料（表二）》有关栏次名称调整如下：
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①第28栏调整为：“其中：海关完税凭证”；
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②第29栏调整为：“农产品收购凭证及普通发票”（此栏不能填写）；
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③第30栏调整为：“废旧物资普通发票”；
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④第31栏调整为：“货物运输发票”。
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3、 在填写申报表主表时要注意第28栏和第30栏的填写，第28栏的填写参照“一、辅导期内应注意的几个问题”中的第2条填写。第30栏按照第25栏的数填写，如果第25栏的数大于0，则把第25栏的数填到第30栏；如果第25栏的数小于0，则第30栏填0或者不填。
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4、 其他报表的填写方法与正式一般纳税人的填写方法相同。
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三、申报流程：
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1、 每月1号以后，在防伪税控开票系统中进行抄税处理；
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2、 在取得“稽核结果通知书”后，在网上申报系统中完成增值税申报；
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3、 纳税人持开票IC卡、“稽核结果通知书”、通过申报软件打印的申报表（包括增值税纳税申报表主表、附表一、附表二、资产负债表、损益表）一份到税务机关报税比对；（有尚未抵缴完的以前月份预缴税款的纳税人在税务机关读税控IC卡之前，要主动向工作人员声明，否则当月将无法抵缴，只能等到以后月份抵缴）
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4、 比对相符的，在网上申报系统中查询申报结果；比对不符的，按照反馈结果的提示进行报表修改后再重复上述2、3步骤。
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1、 辅导期的一般纳税人的纳税辅导期一般为6个月，到期后纳税人应主动向主管税务机关提交转为正式一般纳税人的申请。应在辅导期最后一个月完成申报后，向大厅综合受理窗口提出申请。
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2、 专用发票的领购数量。辅导期一般纳税人每次增值税防伪税控专用发票的领购量最多不得超过25份，发票不够增加数量的应先依据上一次领购并开具的正数专用发票上注明的销售额按4%征收率计算 ，向主管税务机关预缴税款。此预缴税款在次月申报时一定要填写在申报表主表的28栏“分次预缴税款”中，否则当月和以后月份，将无法使用此预缴来抵缴税款。
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4、 进项税额的抵扣。在辅导期内，商贸企业取得的专用发票抵扣联、海关进口增值税专用缴款书、废旧物资发票以及货物运输发票要在交叉稽核比对无误后，方可予以抵扣，未收到主管税务机关稽核比对结果通知书及其明细清单的不准许抵扣。
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5、 待抵扣进项税额的会计核算方法。在“应交税金”科目下增设“待抵扣进项税额”明细科目，核算己通过认证但暂时无法抵扣的专用发票抵扣联、海关进口增值税专用缴款书、废旧物资普通发票以及货物运输发票的进项税额。取得上述扣税凭证时，借记“应交税金——待抵扣进项税额”明细科目 ，贷记相关科目；交叉稽核比对无误允许抵扣后，借记“应交税金——应交增值税（进项税额）”专栏，贷记“应交税金——待抵扣进项税额”科目。经核实不得抵扣的进项税额，红字借记“应交税金——待抵扣进项税额”，红字贷记相关科目。取得需抵扣的铁路运输发票、航空运输发票、海洋运输发票和管道运输发票直接记入“应交税金——应交增值税（进项税额）”。
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6、 辅导期结束后第一个月，将“应交税金——待抵扣进项税额”可允许抵扣的部分（包括比对相符、核查准予抵扣、核查暂无结果）转入“应交税金——应交增值税（进项税额）”，并将数据填入增值税申报表附表二“申报抵扣的进项税额”相关栏次，与本月取得的进项税一并申报抵扣。
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二、申报表的填写方法：
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1、 “稽核结果通知书”上允许抵扣进项税额的申报方法。辅导期一般纳税人在接到“稽核结果通知书”的当月（一定要填写在当月的进项税额中，当月不填写的的视同自行放弃），按以下要求填写《增值税纳税申报表附列资料（表二）》，并于纳税申报时申报抵扣；
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①第3栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符专用发票、协查结果中允许抵扣的专用发票的份数、金额、税额。
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②第5栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符海关完税凭证、协查结果中允许抵扣的海关完税凭证的份数、金额、税额。
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③第7栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符废旧物资普通发票、协查结果中允许抵扣的废旧物资普通发票的份数、金额、 税额。
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④第8栏填写税务机关告知的稽核比对结果通知书及其明细清单注明的稽核相符货物运输发票、协查结果中允许抵扣的货物运输发票的份数、金额、税额。
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⑤第23栏与第3栏填写的内容相同。
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⑦第25栏、第35栏填写的内容与第24栏相同。
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⑧第28栏填写本月未收到稽核比对结果的海关完税凭证数据。
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⑨第30栏填写本月未收到稽核比对结果的废旧物资普通发票数据。
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《增值税纳税申报表附列资料（表二）》有关栏次名称调整如下：
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①第28栏调整为：“其中：海关完税凭证”；
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②第29栏调整为：“农产品收购凭证及普通发票”（此栏不能填写）；
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④第31栏调整为：“货物运输发票”。
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3、 在填写申报表主表时要注意第28栏和第30栏的填写，第28栏的填写参照“一、辅导期内应注意的几个问题”中的第2条填写。第30栏按照第25栏的数填写，如果第25栏的数大于0，则把第25栏的数填到第30栏；如果第25栏的数小于0，则第30栏填0或者不填。
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4、 其他报表的填写方法与正式一般纳税人的填写方法相同。
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三、申报流程：
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1、 每月1号以后，在防伪税控开票系统中进行抄税处理；
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2、 在取得“稽核结果通知书”后，在网上申报系统中完成增值税申报；
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3、 纳税人持开票IC卡、“稽核结果通知书”、通过申报软件打印的申报表（包括增值税纳税申报表主表、附表一、附表二、资产负债表、损益表）一份到税务机关报税比对；（有尚未抵缴完的以前月份预缴税款的纳税人在税务机关读税控IC卡之前，要主动向工作人员声明，否则当月将无法抵缴，只能等到以后月份抵缴）
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4、 比对相符的，在网上申报系统中查询申报结果；比对不符的，按照反馈结果的提示进行报表修改后再重复上述2、3步骤。
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