1. 按感染的对象分
动物病毒、植物病毒、细菌病毒、昆虫病毒及真菌病毒，另外尚有类病毒(Viroids)拟病毒(Virusoid)和朊病毒(Prion)。
2. 按遗传物质分类分（分子结构）
DNA病毒和RNA病毒两大类，其遗传物质单股(single strand)或双股(double strand)、核酸分子量、RNA为正义(sense)或反义(antisence) RNA都是主要的分类依据。
3.按基因结构划分（基因结构）
DNA病毒
l 腺病毒科 Adenoviridae
l 疱疹病毒科 Herpesviridae EBV 带状疱疹病毒
l 虹彩病毒科 Iridoviridae
l 乳头多瘤空泡病毒Papovaviruses
l 小DNA病毒科 Parvoviridae
l 痘病毒科 Poxviridae 天花病毒 牛痘病毒
l 嗜肝DNA病毒科Viral Hepatitis乙型肝炎病毒
RNA病毒
l 冠状病毒科 Coronaviridae 严重急性呼吸道综合症病毒
l 玻那病毒科 Bornaviridae
l 纤维病毒科 Filoviridae *埃博拉病毒
l 正黏液病毒科 Orthomyxoviridae *流感病毒 influenza virus *禽流感病毒Avian influenza l 副黏液病毒科 Paramyxoviridae 腮腺炎病毒 麻疹病毒 人类呼吸道融合病毒 l 小核醣核酸病毒 Picornaviruses 鼻病毒 肠道病毒
l 反转录病毒科 Retroviridae *艾滋病病毒 HIV
l 呼肠孤病毒科Reoviridae
l 炮弹病毒科 Rhabdoviridae 狂犬病毒Rabies Virus
噬菌体
噬菌体bacteriophage，简称phage，寄生于细菌中病毒的总称。
1. 按感染的对象分
动物病毒、植物病毒、细菌病毒、昆虫病毒及真菌病毒，另外尚有类病毒(Viroids)拟病毒(Virusoid)和朊病毒(Prion)。
2. 按遗传物质分类分（分子结构）
DNA病毒和RNA病毒两大类，其遗传物质单股(single strand)或双股(double strand)、核酸分子量、RNA为正义(sense)或反义(antisence) RNA都是主要的分类依据。
3.按基因结构划分（基因结构）
DNA病毒
l 腺病毒科 Adenoviridae
l 疱疹病毒科 Herpesviridae EBV 带状疱疹病毒
l 虹彩病毒科 Iridoviridae
l 乳头多瘤空泡病毒Papovaviruses
l 小DNA病毒科 Parvoviridae
l 痘病毒科 Poxviridae 天花病毒 牛痘病毒
l 嗜肝DNA病毒科Viral Hepatitis乙型肝炎病毒
RNA病毒
l 冠状病毒科 Coronaviridae 严重急性呼吸道综合症病毒
l 玻那病毒科 Bornaviridae
l 纤维病毒科 Filoviridae *埃博拉病毒
l 正黏液病毒科 Orthomyxoviridae *流感病毒 influenza virus *禽流感病毒Avian influenza l 副黏液病毒科 Paramyxoviridae 腮腺炎病毒 麻疹病毒 人类呼吸道融合病毒 l 小核醣核酸病毒 Picornaviruses 鼻病毒 肠道病毒
l 反转录病毒科 Retroviridae *艾滋病病毒 HIV
l 呼肠孤病毒科Reoviridae
l 炮弹病毒科 Rhabdoviridae 狂犬病毒Rabies Virus
噬菌体
噬菌体bacteriophage，简称phage，寄生于细菌中病毒的总称。