物理化学学报(WuliHuaxueXuebao)
1018[Article]
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007,23(7):1018-1024July
www.whxb.pku.edu.cn
尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
郑文锐
傅
尧*
刘
磊
230026)
郭庆祥
(中国科学技术大学化学系,合肥
摘要:
利用量子化学二级微扰理论方法对尿素及硫脲衍生物与羰基化合物之间的氢键复合物进行了研究,在
自然键轨道分析基础上进一步揭示了氢键本质并研究了取代基效应.结果表明,羰基化合物中供电子基和共轭基,尿素及硫脲中的吸电子基和共轭基均有利于氢键的形成.结合尿素与硫脲的催化反应过程,讨论了氢键复合物两种可能的顺反异构并分析比较了顺反式构象异构体的稳定能大小.
关键词:氢键;羰基化合物;顺反异构;尿素;硫脲
中图分类号:O641
HydrogenBondingInteractionbetweenUreasorThioureas
andCarbonylCompounds
ZHENGWen-Rui
FUYao*
LIULei
GUOQing-Xiang
(DepartmentofChemistry,UniversityofScienceandTechnologyofChina,Hefei230026,P.R.China)Abstract:ThehydrogenbondinginteractionsbetweenureasorthioureasanddifferentcarbonylcompoundswerestudiedusingtheMoller-Plessetperturbationtheory(MP2)method.Thenaturalbondorbitalanalysisfurtherdisclosedtheessenceofthehydrogenbondinginteraction.Inaddition,thesubstituenteffectswereinvestigatedandtheresultsindicatedthatboththeelectron-withdrawinggroupsonureas(thioureas)andelectron-donatinggroupsoncarbonylcompoundscanfacilitatethehydrogenbondingformation.Twopossiblehydrogenbondingcomplexconformations,cisandtrans,werediscussedandtheenergygapsbetweenthemwereanalyzed,incombinationwiththecatalyticreactions.KeyWords:
Hydrogenbond;Carbonylcompound;cis-transisomerization;Urea;Thiourea
尿素和硫脲类化合物因具有较强的氢键活性而被广泛运用于分子识别领域中[1],近年来的研究表明这一类化合物作为有机催化剂能通过多氢键作用活化羰基化合物、亚胺化合物、硝基化合物等多种反应物,并且能得到具有较高对映选择性(ee%)和非对映选择性(dr%)的产物[2].例如,Schreiner等[3]发现硫脲类催化剂能大大加快环戊二烯和!,"不饱和羰基化合物之间的Diels-Alder反应速率;Jacobsen等[4]报道了手性尿素及硫脲化合物能催化多种对映选择性反应,包括Strecker反应,aza-Baylis-Hillman反应,
aza-Mannich反应和Pictet-Spengler反应等.同时,
Takemoto等[5]发展了新型的硫脲催化剂用于对映选择性aza-Henry反应及1,3-二羰基化合物和硝基烯烃的Michael反应中.此外,有人报道了手性尿素及硫脲催化剂催化吖内酯的醇解反应,产物的ee%值较高[6,7].
实验研究表明,尿素及硫脲类化合物与羰基化
合物、硝基化合物等反应物之间的氢键相互作用在化学选择性的调控中发挥了重要作用,通过理论方法研究其氢键相互作用对理解反应机理将具有积极
Received:December21,2006;Revised:March29,2007;PublishedonWeb:May10,2007.
Englisheditionavailableonlineatwww.sciencedirect.com*
Correspondingauthor.Email:fuyao@ustc.edu.cn;Tel:+86551-3607476.国家自然科学基金(20602034)资助项目
!EditorialofficeofActaPhysico-ChimicaSinica
No.7郑文锐等:尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
1019
键键能(即键生成焓)时运用MP2/6-31+G(d,p)的方法并用Boys和Bernardi的完全均衡校正(counter-
poiseprocedure)[8]消除基组重叠误差(BSSE).在MP2/6-31+G(d,p)水平上进行自然键轨道(NBO)[9]分析.全
部计算均用Gaussian03程序包[10]完成.
2
2.1
图1
尿素和硫脲活化羰基化合物过程
结果与讨论
非取代尿素和硫脲与羰基化合物间氢键作用先讨论非取代尿素及硫脲与羰基化合物之间的
Fig.1
Carbonylactivationbyaureaor
thioureacatalyst
氢键作用及其基本结构.图2为尿素和硫脲与甲醛,丙酮,乙酸甲酯,N,N-二甲基乙酰胺,苯甲醛,苯乙酮及乙醛等羰基化合物之间形成的氢键复合物的构型.比较羰基化合物羰基平面与尿素(硫脲)骨架共面或垂直两种可能构型可知,尿素与丙酮、乙酸甲酯、
X=OorS,LorL′=alargegroup,SorS′=asmallgroup
意义,有助于设计性能更好的尿素及硫脲类催化剂.目前虽然已经提出一些反应机理来解释实验现象[3-5],但是有关尿素及硫脲催化的基本问题仍然没有得到很好的解释.以羰基化合物为例,普遍认为尿素及硫脲与羰基化合物之间是通过形成双氢键复合物来活化反应物的(图1).根据取代基大小相对位置的不同氢键复合物具有两种可能的异构体(顺式cis和反式
N,N-二甲基乙酰胺、苯乙酮及乙醛之间形成的氢键
复合物羰基化合物的羰基平面与尿素骨架近乎垂直,其余几种复合物羰基平面与尿素骨架几乎在同一平面上.硫脲与乙酸甲酯、苯N,N-二甲基乙酰胺、乙酮之间形成的复合物中,羰基平面与硫脲骨架近乎垂直的构型较稳定,其余几种氢键复合物则是羰基平面与硫脲骨架近乎共面的构型较稳定.由图2
trans),提出这个概念有利于理解反应机理及产物的
对映及非对映选择性.
如果顺式和反式复合物之间的稳定性差别较大,则氢键复合物主要以一种构象存在,并受到亲核试剂的进攻,由于空间位阻的影响将可能产生两种进攻方式,得到两种结构的过渡态;如果两种构象稳定性差别很小,则顺反式构象异构体将同时受到亲核试剂的进攻,得到四种不同结构的过渡态.这四种可能过渡态的相对能垒高度决定了总反应的ee%和dr%值.在本文中,我们利用二级微扰理论MP2方法研究了气态常温常压条件下尿素及硫脲类化合物与不同种羰基化合物的氢键作用及氢键复合物的顺反异构现象,通过调节具有不同电子效应和空间效应的取代基,探讨取代基的电子效应和空间效应对氢键强弱及氢键复合物顺反异构的影响.
1计算方法
运用B3LYP/6-31G(d)方法对单体和氢键复合
物进行结构优化,比较多种可能的构象,对稳定点构象的几何构型进行谐振子振动频率分析,得到的振动频率无虚频,表明所有优化的几何构型均为势能面上的极小值点,同时得到热力学校正值(TCE).单点能(SP)的计算运用MP2/6-31+G(d,p)方法,计算氢
图2
尿素和硫脲与不同羰基化合物氢键复合物构型
Fig.2Conformationsofhydrogenbonding
complexesofureaorthioureawithdifferentcarbonylcompounds
1020
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
Vol.23
可以看出,尿素和硫脲与这几种典型的羰基化合物都能形成较强的双氢键,氢键键长H…O在0.209-
动频率为3539.2cm-1,红移了22.9cm-1,N—H键键长增加到0.1015和0.1016nm.
表1列出了经自然键轨道集居分析所得的尿素和硫脲与这几种羰基化合物形成的氢键复合物构型的电子供体(donor)轨道i与电子受体(acceptor)轨道
0.237nm之间,而且该氢键具有典型氢键的特征[11].
例如,形成氢键前,尿素单体质子给体N—H键键长
0.1013nm,N—H键对称伸缩振动频率为3562.1cm-1;与N,N-二甲基乙酰胺形成氢键后,对称伸缩振
表1
j之间的二阶相互作用稳定化能E(2)及氢键键能!E.
氢键复合物的二阶相互作用稳定化能E(2)及氢键键能(!E)的自然轨道分析结果
Table1
Complex1U
TheNBOsecond-orderinteractionenergies(E(2))andhydrogenbondingenergies(!E)of
hydrogenbondingcomplexes
Naturalcharge(e)N(1)-0.97973H(2)0.44068N(3)-0.97966H(4)0.44072O(5)-0.64499C(6)0.35201N(1)-0.98232H(2)0.44058N(3)-0.98521H(4)0.44077O(5)-0.69931C(6)0.70198N(1)-0.98410H(2)0.44188N(3)-0.98404H(4)0.44225O(5)-0.76263C(6)1.00130N(1)-0.98583H(2)0.44610N(3)-0.98893H(4)0.44766O(5)-0.79997C(6)0.85897N(1)-0.98090H(2)0.44589N(3)-0.97843H(4)0.44011O(5)-0.68838C(6)0.53955N(1)-0.98371H(2)0.44171N(3)-0.98351H(4)0.44149O(5)-0.71055C(6)0.70440N(1)-0.98203H(2)0.43482N(3)-0.98736H(4)0.44211O(5)-0.67569C(6)0.52390N(1)-0.93687H(2)0.44840N(3)-0.93680H(4)0.44832O(5)-0.65653C(6)0.36064N(1)-0.93809H(2)0.45323N(3)-0.93798H(4)0.45341O(5)-0.70891C(6)0.71284
DonorNBO(i)LP(1)O5
LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5BD(2)O5-C6LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5
AcceptorNBO(j)BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2
*
・E(2)/(kJmol-1)
・ΔE/(kJmol-1)
-13.5
12.312.35.45.3
-19.7
7.37.011.38.2
-19.3
13.012.74.94.6
-29.4
12.211.115.38.6
-16.9
14.912.710.02.8
-20.6
8.38.59.29.6
-16.4
6.917.43.74.5
-16.5
17.117.07.37.1
-23.2
20.220.28.99.0
2U
3U
4U
5U
BD(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4
*
6U
BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N1—H2BD(1)N1—H2BD*(1)N3—H4
*
7U
1T
BD*(1)N1-H2BD*(1)N3—H4BD(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2
*
2T
tobecontinued
No.7
ContinuedTable1
郑文锐等:尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
1021
(2)H(2)0.44903LP(1)O5BD*(1)N3—H415.5N(3)-0.94087LP(1)O5BD*(1)N1—H215.2H(4)0.44942LP(2)O5BD*(1)N3—H45.1
*
4.8O(5)-0.76803LP(2)O5BD(1)N1—H2
C(6)1.00478
4TN(1)-0.94063-34.2
H(2)0.45516LP(1)O5BD*(1)N3—H414.5N(3)-0.94584LP(1)O5BD*(1)N1—H214.7H(4)0.45503LP(2)O5BD*(1)N3—H417.8
*
O(5)-0.80647BD(2)O5-C6BD(1)N1—H29.9C(6)0.86023
5TN(1)-0.93681-20.7
*
—H(2)0.45406LP(1)O5BD(1)N1H219.4
N(3)-0.93659LP(1)O5BD*(1)N3—H419.2
*
H(4)0.44956LP(2)O5BD(1)N1—H213.2O(5)-0.70219LP(2)O5BD*(1)N3—H44.22C(6)0.54732
6TN(1)-0.93720-24.0
*
H(2)0.44897LP(1)O5BD(1)N3—H411.3N(3)-0.94262LP(1)O5BD*(1)N1—H210.2
*
15.1H(4)0.44989LP(2)O5BD(1)N3—H4
O(5)-0.71761BD(2)O5-C6BD*(1)N1—H26.5C(6)0.70818
7TN(1)-0.93824
H(2)0.45112LP(1)O5BD*(1)N3—H418.8-20.0N(3)-0.93714LP(1)O5BD*(1)N1—H219.3H(4)0.45181LP(2)O5BD*(1)N3—H47.6
*
—O(5)-0.68686LP(2)O5BD(1)N1H29.0
C(6)0.54585
ThenumbersforthecompoundsandatomsarethesameasinFig.2.BD*denotesantibondingorbital,LPdenoteslone-pair.
BD*(1)denotes"orbital,BD*(2)denotes!orbital.LP(1)andLP(2)denotethefirstandthesecondlonepairelectrons,respectively.
稳定化能E(2)越大,表示i与j的相互作用越强,即i提供电子给j的倾向越大.氢键相互作用部分原子的自然电荷也列入表中,化合物及原子编号与图2中保持一致.单体的自然电荷未列出.
从氢键键能数据可以看出,硫脲与羰基化合物之间的氢键作用强于尿素,这是因为硫脲的供质子能力强于尿素,硫脲与尿素的pKa分别为21.0和
子受体氧原子的净电荷减小.如形成氢键前单体尿素的质子给体N—H键上氢原子的净电荷分别为
26.9[12].尿素与硫脲和N,N-二甲基乙酰胺之间的氢键
最强,可见,羰基化合物羰基碳原子上的取代基对氢键强弱有较大的影响,具有给电子诱导效应的取代基有利于氢键的形成,另外,N,N-二甲基氨基上的氮原子和甲氧基上的氧原子的孤对电子与羰基之间还存在p-!共轭作用,使得羰基氧原子上的电子密度增加,接受质子的能力增强,因此氢键容易形成,而且,共轭基团如苯环,能与羰基形成!-!共轭,其相应的羰基化合物与尿素(硫脲)形成的氢键作用也较强,另外,相比于甲基,甲氧基等取代基同时还具有较大的空间位阻效应,但共轭效应的影响比空间效应的影响大.键能强弱顺序与氢键键长的变化顺序是一致的.
由自然键轨道自然电荷布居分析可知,与单体相比,质子给体N—H键上氢原子的净电荷增加,质
0.42456e和0.42465e,羰基化合物甲醛的质子受体氧原子的净电荷为-0.59878e,形成1U后则分别变为0.44068e,0.44072e和-0.64499e.对于其它氢键复合物,电荷变化的规律相同.两单体临近的原子自然电荷变化较大,羰基化合物与形成氢键前相比,净电荷增加,电子是由羰基化合物单体向尿素或硫脲
单体传递,氢键越强,电荷的转移量越大,单体临近原子的自然电荷变化也越大.例如,化合物1U,形成氢键后羰基化合物甲醛部分的总电荷(将复合物中羰基化合物所有原子的净电荷相加得到)为0.00811e,电子由甲醛向尿素转移的净电荷数为0.00811e,化合物1T,形成氢键后甲醛部分的总电荷为0.01186e,电子由甲醛向硫脲转移的净电荷数为0.01186e.表中列出二阶稳定化能较大的几项,氢键复合物的分子间作用主要发生在羰基氧原子的两对孤对电子与相近的N(1)—H(2)和N(3)—H(4)的"*反键轨道之间,对于部分氢键化合物,羰基!轨道电子与N—H反键轨道之间还存在较微弱的相互作用.对于氢键键能较大的复合物,羰基氧原子的孤对电子与N—
H键间的二阶相互作用稳定化能也相对较强,进一
1022
表2
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
取代硫脲与N,N-二甲基乙酰胺氢键复合物的氢键键能
Vol.23
电子密度以及羰基最低未占有轨道"*的能量,从而活化羰基以利于亲核试剂的进攻,氢键强则更有利于亲核试剂进攻羰基.
由图1知,对于具有羰基化合物的羰基平面与尿素(硫脲)骨架接近垂直的构型的氢键复合物,在空间位置上不存在顺反异构的可能,而对于羰基平面与尿素(硫脲)骨架几乎在同一平面的构型,可能会存在空间上的顺反异构.因此,表3和表4分别列出了尿素与苯甲醛,硫脲与乙醛在不同取代基条件下可能存在的顺反式异构体的氢键键能,用!E(cis)和
Table2ThehydrogenbondingenergiesofsubstitutedthioureaswithN,N-dimethylacetamide
R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)
-33.5-31.9
-53.2-35.5
!E(trans)表示,同时用!E(cis)-!E(trans)来表示顺反
异构体构象之间1的稳定性差.单位均为kJ・mol-1.由
于只有尿素和硫脲两个氮原子上取代基不一致的条件下才存在空间位置上的顺反异构,且为了简化计
—CF3-58.2-57.7
算,此处取代基R仅取代一个氮原子上的氢.
从表3和表4看出,对于具有不同电子效应和空间效应取代基的单取代尿素及硫脲,氢键键能的变化规律与前面讨论的双取代硫脲的变化规律是一致的.尿素和硫脲分别与苯甲醛、乙醛形成的氢键复合物顺反异构体之间的能量差在-3.4-0.0kJ・mol-1
表3
尿素与苯甲醛氢键复合物键能及顺反异构键能差
步揭示了该类氢键的本质.
2.2取代硫脲与羰基化合物间氢键作用及氢键复合物的顺反异构
表2列出了具有较强氢键作用的取代硫脲与
N,N-二甲基乙酰胺之间的氢键键能.在2.1节得到
的结构基础上,通过改变硫脲中氮原子上的取代基,得到不同取代基条件下的氢键键能.R为甲基和苯基时,硫脲与N,N-二甲基乙酰胺形成的氢键复合物羰基化合物的羰基平面与硫脲骨架近乎垂直.从键能的相对大小可以看出,硫脲氮原子上的取代基对氢键键能有较大的影响,具有强吸电子诱导效应的取代基如三氟甲基能很大程度上增加氢键强度,而如甲基等供电子取代基氢键作用较弱,共轭取代基苯基也有利于氢键的形成,这是由于具有吸电子诱
导效应以及能与氮原子形成共轭作用的基团均能稳定氮原子上的负电荷,质子供体氮氢键的酸性增加,氢键容易生成.另外,苯基、五氟苯基、!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基还具有较强的空间位阻效应,但可以看出,空间效应对氢键强弱的影响不及电子效应和共轭效应的影响大.对于尿素,取代基的这种变化规律是一致的.!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基为文献中报道的常用的硫脲和尿素催化剂的取代基团,3,5-三氟甲基苯基取代硫脲与羰基化合物形成的氢键作用较强.形成氢键的强弱直接影响亲核试剂对羰基的进攻,尿素和硫脲可视为
Table3Thehydrogenbondingenergiesandcis-
transenergygaps(unitinkJ・mol-1)ofurea/
benzaldehydecomplexes
R—CH3
ΔE(cis)-15.2
ΔE(trans)-15.1
ΔE(cis)-ΔE(trans)
-0.1
-27.5-26.8-0.7
—CF3-29.9-26.1
-28.5-23.4
-1.4-2.7
-12.6-10.6-2.0
Lewis酸,羰基氧原子上的孤对电子可视为Lewis
碱中心,与Lewis酸结合能够大大降低氧原子上的
-33.7-31.5-2.2
1022
表2
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
取代硫脲与N,N-二甲基乙酰胺氢键复合物的氢键键能
Vol.23
电子密度以及羰基最低未占有轨道"*的能量,从而活化羰基以利于亲核试剂的进攻,氢键强则更有利于亲核试剂进攻羰基.
由图1知,对于具有羰基化合物的羰基平面与尿素(硫脲)骨架接近垂直的构型的氢键复合物,在空间位置上不存在顺反异构的可能,而对于羰基平面与尿素(硫脲)骨架几乎在同一平面的构型,可能会存在空间上的顺反异构.因此,表3和表4分别列出了尿素与苯甲醛,硫脲与乙醛在不同取代基条件下可能存在的顺反式异构体的氢键键能,用!E(cis)和
Table2ThehydrogenbondingenergiesofsubstitutedthioureaswithN,N-dimethylacetamide
R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)
-33.5-31.9
-53.2-35.5
!E(trans)表示,同时用!E(cis)-!E(trans)来表示顺反
异构体构象之间1的稳定性差.单位均为kJ・mol-1.由
于只有尿素和硫脲两个氮原子上取代基不一致的条件下才存在空间位置上的顺反异构,且为了简化计
—CF3-58.2-57.7
算,此处取代基R仅取代一个氮原子上的氢.
从表3和表4看出,对于具有不同电子效应和空间效应取代基的单取代尿素及硫脲,氢键键能的变化规律与前面讨论的双取代硫脲的变化规律是一致的.尿素和硫脲分别与苯甲醛、乙醛形成的氢键复合物顺反异构体之间的能量差在-3.4-0.0kJ・mol-1
表3
尿素与苯甲醛氢键复合物键能及顺反异构键能差
步揭示了该类氢键的本质.
2.2取代硫脲与羰基化合物间氢键作用及氢键复合物的顺反异构
表2列出了具有较强氢键作用的取代硫脲与
N,N-二甲基乙酰胺之间的氢键键能.在2.1节得到
的结构基础上,通过改变硫脲中氮原子上的取代基,得到不同取代基条件下的氢键键能.R为甲基和苯基时,硫脲与N,N-二甲基乙酰胺形成的氢键复合物羰基化合物的羰基平面与硫脲骨架近乎垂直.从键能的相对大小可以看出,硫脲氮原子上的取代基对氢键键能有较大的影响,具有强吸电子诱导效应的取代基如三氟甲基能很大程度上增加氢键强度,而如甲基等供电子取代基氢键作用较弱,共轭取代基苯基也有利于氢键的形成,这是由于具有吸电子诱
导效应以及能与氮原子形成共轭作用的基团均能稳定氮原子上的负电荷,质子供体氮氢键的酸性增加,氢键容易生成.另外,苯基、五氟苯基、!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基还具有较强的空间位阻效应,但可以看出,空间效应对氢键强弱的影响不及电子效应和共轭效应的影响大.对于尿素,取代基的这种变化规律是一致的.!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基为文献中报道的常用的硫脲和尿素催化剂的取代基团,3,5-三氟甲基苯基取代硫脲与羰基化合物形成的氢键作用较强.形成氢键的强弱直接影响亲核试剂对羰基的进攻,尿素和硫脲可视为
Table3Thehydrogenbondingenergiesandcis-
transenergygaps(unitinkJ・mol-1)ofurea/
benzaldehydecomplexes
R—CH3
ΔE(cis)-15.2
ΔE(trans)-15.1
ΔE(cis)-ΔE(trans)
-0.1
-27.5-26.8-0.7
—CF3-29.9-26.1
-28.5-23.4
-1.4-2.7
-12.6-10.6-2.0
Lewis酸,羰基氧原子上的孤对电子可视为Lewis
碱中心,与Lewis酸结合能够大大降低氧原子上的
-33.7-31.5-2.2
No.7
表4
郑文锐等:尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
硫脲与乙醛氢键复合物键能及顺反异构键能差
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Table4Thehydrogenbondingenergiesandcis-transenergygaps(unitinkJ・mol-1)ofthiourea/
acetaldehydecomplexes
R—CH3
ΔE(cis)-19.4
ΔE(trans)-19.4
ΔE(cis)-ΔE(trans)
0.0
-26.9-26.7-0.2
—CF3-29.7-23.6
-28.8-20.2
-0.9-3.4
图3表3中R为苯基时顺反异构体的结构及二阶相互
作用稳定化能
-20.6-20.0-0.6
Fig.3cis-transconformationsandsecond-order
interactionenergiesofhydrogenbondingcomplexes
inTable3whenRisphenyl
-29.1-27.4-1.7
相条件下尿素和硫脲与羰基化合物形成顺反异构氢键复合物的反应,根据热力学循环,表中的!E(cis)-
之间,差别较小且顺式结构较反式稳定.在HF/6-
!E(trans)表示顺反式异构体之间的焓值差!H.由热力学函数关系式!H=!U+!(pV),知内能差!U的范
围也在-3.4-0.0kJ・mol-1之间,由统计热力学最概然分布Ncis/Ntrans=e-!U/RT,Ncis和Ntrans分别表示顺反式异构体的微观粒子数目,可以计算出在298.15K气相常压条件下,Ncis/Ntrans的范围在1.0-3.9之间.因此,尿素和硫脲与羰基化合物形成的氢键复合物顺反式异构体同时存在,两者之间的平衡决定总反应的ee%和dr%值.
31+G(d,p)水平下用NBO¥del删除特定轨道的方法
来分析表3中R为苯基的情形(考虑到NBO¥del只能用于SCF的方法分析),顺式结构较反式结构稳定了
・11.4kJmol-1,图3为这两种异构体的结构,同时也列
出了电子供体轨道i与电子受体轨道j之间的二阶相互作用稳定化能E(2),对顺式复合物删除LP(1)O11与反键轨道BD*(1)N7—H20以及LP(2)O11与反键轨道
BD*(1)N10—H19之间的轨道相互作用,对反式复合物删除LP(1)O11与反键轨道BD*(1)N7—H19以及LP(2)O11与反键轨道BD*(1)N9—H20之间的轨道相互作用,由NBO¥del分析结果得出,顺式复合物的能量与删除之前比,能量增加了29.7kJ・mol-1,反式复合物的能量与删除之前比,能量增加了24.7kJ・mol-1,可以看出,顺式较反式稳定的本质原因来自于顺式结构中羰基氧原子孤对电子轨道LP(1)O11与反键轨道BD*(1)N7—H20以及孤对电子轨道LP(2)O11与反键轨道BD*(1)N10—H19之间的轨道相互
作用,且能量变化的大小规律与二阶相互作用稳定化能大小的规律是一致的.
用A+B→ABcis和A+B#ABtrans来分别表示气
3结论
利用二级微扰理论MP2方法研究了气态常温常压条件下尿素及硫脲类化合物与不同种羰基化合物之间的氢键作用以及氢键复合物的顺反异构现象,讨论了取代基的电子效应和空间效应对氢键强弱及氢键复合物顺反异构的影响.结果表明,尿素和硫脲类化合物与羰基化合物之间能形成具有典型氢键特征的双氢键,质子供体N—H键键长在形成氢键后增加,其伸缩振动频率也相应地发生红移.羰基化合物中具有供电子诱导效应的取代基以及能与羰基形成共轭作用的取代基均使得羰基氧原子的电子密度增加,有利于氢键的形成,而尿素和硫脲中的强吸电
1024
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
2003,125:12672
Vol.23
子诱导效应取代基以及能与氮原子形成共轭作用的取代基能增加其供质子能力,形成的氢键越强,同时尿素和硫脲中的取代基的空间位阻效应对氢键强弱的影响程度不大.由自然键轨道分析揭示了氢键相互作用的本质,形成氢键后羰基化合物单体带正电荷,羰基氧原子的净电荷减小,电子是由羰基化合物单体对尿素和硫脲类化合物单体传递.氢键复合物的分子间作用主要是发生在羰基氧原子的孤对电子和相近的N—H!*反键轨道之间.通过调节尿素和硫脲具有不同电子效应和空间效应的取代基发现,氢键复合物的顺反异构体能量差别较小,两种异构体同时共存,因此对于尿素及硫脲与羰基化合物的催化反应过程,需要同时对四种不同结构的过渡态进行研究.
References
1
(a)Kelly,T.R.;Kim,M.H.J.Am.Chem.Soc.,1994,116:7072(b)Wilcox,C.S.;Kim,E.;Romano,D.;Kuo,L.H.;Burt,A.L.;Curran,D.P.Tetrahedron,1995,51:621
(c)Linton,B.R.;Goodman,M.S.;Hamilton,A.D.Chem.Eur.J.,2000,6:2449234
(a)Dalko,P.I.;Moisan,L.Angew.Chem.Int.Ed.,2004,43:5138(b)Takemoto,Y.Org.Biomol.Chem.,2005,3:4299(a)Schreiner,P.R.;Wittkopp,A.Org.Lett.,2002,4:217(b)Wittkopp,A.;Schreiner,P.R.Chem.Eur.J.,2003,9:407(a)Sigman,M.S.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,1998,120:4901
(b)Sigman,M.S.;Vachal,P.;Jacobsen,E.N.Angew.Chem.Int.Ed.,2000,39:1279
(c)Vachal,P.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2002,124:10012
(d)Vachal,P.;Jacobsen,E.N.Org.Lett.,2000,2:867
(e)Su,J.T.;Vachal,P.;Jacobsen,E.N.Adv.Synth.Catal.,2001,343:197
(f)Wenzel,A.G.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2002,124:12964
(g)Wenzel,A.G.;Lalonde,M.P.;Jacobsen,E.N.Synlett,2003:1919
(h)Joly,G.D.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2004,126:4102
(i)Taylor,M.S.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2004,126:10558
(j)Taylor,M.S.;Tokunaga,N.;Jacobsen,E.N.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:6700
(k)Raheem,I.T.;Jacobsen,E.N.Adv.Synth.Catal.,2005,347:17015
(a)Okino,T.;Hoashi,Y.;Takemoto,Y.TetrahedronLett.,2003,44:2817
(b)Okino,T.;Hoashi,Y.;Takemoto,Y.J.Am.Chem.Soc.,
76
(c)Okino,T.;Nakamura,S.;Furukawa,T.;Takemoto,Y.Org.Lett.,2004,6:625
(d)Hoashi,Y.;Yabuta,T.;Takemoto,Y.TetrahedronLett.,2004,45:9185
(e)Okino,T.;Hoashi,Y.;Furukawa,T.;Xu,X.;Takemoto,Y.J.Am.Chem.Soc.,2005,127:119
(f)Hoashi,Y.;Okino,T.;Takemoto,Y.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:4032
(g)Hoashi,Y.;Yabuta,T.;Yuan,P.;Miyabe,H.;Takemoto,Y.Tetrahedron,2005,62:365
(h)Xu,X.;Yabuta,T.;Yuan,P.;Takemoto,Y.Synlett,2006:137(i)Xu,X.;Furukawa,T.;Okino,T.;Miyabe,H.;Takemoto,Y.Chem.Eur.J.,2006,12:466
(a)Berkessel,A.;Cleemann,F.;Mukherjee,S.;Mueller,T.N.;Lex,J.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:807
(b)Berkessel,A.;Mukherjee,S.;Cleemann,F.;Mueller,T.N.;Lex,J.Chem.Commun.,2005:1898
(a)Curran,D.P.;Kuo,L.H.J.Org.Chem.,1994,59:3259(b)Curran,D.P.;Kuo,L.H.TetrahedronLett.,1995,36:6647(c)Sohtome,Y.;Tanatani,A.;Hashimoto,Y.;Nagasawa,K.Chem.Pharm.Bull.,2004,52:477
(d)Dessole,G.;Herrera,R.P.;Ricci,A.Synlett,2004:2374(e)Sohtome,Y.;Tanatani,A.;Hashimoto,Y.;Nagasawa,K.TetrahedronLett.,2004,45:5589
(f)Li,B.J.;Jiang,L.;Liu,M.;Chen,Y.C.;Ding,L.S.;Wu,Y.Synlett,2005:603
(g)Vakulva,B.;Varga,S.;Csampai,A.;Soos,T.Org.Lett.,2005,7:1967
(h)Wang,J.;Li,H.;Yu,X.;Zu,L.;Wang,W.Org.Lett.,2005,7:4293
(i)Wang,J.;Li,H.;Duan,W.;Zu,L.;Wang,W.Org.Lett.,2005,7:4713
(j)Dove,A.P.;Pratt,R.C.;Lohmeijer,B.G.G.;Waymouth,R.M.;Hedrick,J.L.J.Am.Chem.Soc.,2005,127:13798(k)McCooey,S.H.;Connon,S.J.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:6367
(l)Herrera,R.P.;Sgarzani,V.;Bernardi,L.;Ricci,A.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:6576
(m)Sohtome,Y.;Hashimoto,Y.;Nagasawa,K.Adv.Synth.Catal.,2005,347:1643
(n)Tsogoeva,S.B.;Yalalov,D.A.;Hateley,M.J.;Weckbecker,C.;Huthmacher,K.Eur.J.Org.Chem.,2005:49958Boys,S.F.;Bernardi,F.Mol.Phys.,1970,19:553
9Reed,A.E.;Curtiss,L.A.;Weinhold,F.Chem.Rev.,1988,88:899101112
Frisch,M.J.;Trucks,G.W.;Schlegel,H.B.;etal.Gaussian03,RevisionA.1.PittsburghPA:GaussianInc.,2003
Li,Q.;Huang,F.Q.Acta.Phys.-Chim.Sin.,2005,21(1):52[李
权,黄方千.物理化学学报,2005,21(1):52]
Bordwell,F.G.;Algrim,D.J.;Harrelson,Jr.J.A.J.Am.Chem.Soc.,1988,110:5903
物理化学学报(WuliHuaxueXuebao)
1018[Article]
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007,23(7):1018-1024July
www.whxb.pku.edu.cn
尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
郑文锐
傅
尧*
刘
磊
230026)
郭庆祥
(中国科学技术大学化学系,合肥
摘要:
利用量子化学二级微扰理论方法对尿素及硫脲衍生物与羰基化合物之间的氢键复合物进行了研究,在
自然键轨道分析基础上进一步揭示了氢键本质并研究了取代基效应.结果表明,羰基化合物中供电子基和共轭基,尿素及硫脲中的吸电子基和共轭基均有利于氢键的形成.结合尿素与硫脲的催化反应过程,讨论了氢键复合物两种可能的顺反异构并分析比较了顺反式构象异构体的稳定能大小.
关键词:氢键;羰基化合物;顺反异构;尿素;硫脲
中图分类号:O641
HydrogenBondingInteractionbetweenUreasorThioureas
andCarbonylCompounds
ZHENGWen-Rui
FUYao*
LIULei
GUOQing-Xiang
(DepartmentofChemistry,UniversityofScienceandTechnologyofChina,Hefei230026,P.R.China)Abstract:ThehydrogenbondinginteractionsbetweenureasorthioureasanddifferentcarbonylcompoundswerestudiedusingtheMoller-Plessetperturbationtheory(MP2)method.Thenaturalbondorbitalanalysisfurtherdisclosedtheessenceofthehydrogenbondinginteraction.Inaddition,thesubstituenteffectswereinvestigatedandtheresultsindicatedthatboththeelectron-withdrawinggroupsonureas(thioureas)andelectron-donatinggroupsoncarbonylcompoundscanfacilitatethehydrogenbondingformation.Twopossiblehydrogenbondingcomplexconformations,cisandtrans,werediscussedandtheenergygapsbetweenthemwereanalyzed,incombinationwiththecatalyticreactions.KeyWords:
Hydrogenbond;Carbonylcompound;cis-transisomerization;Urea;Thiourea
尿素和硫脲类化合物因具有较强的氢键活性而被广泛运用于分子识别领域中[1],近年来的研究表明这一类化合物作为有机催化剂能通过多氢键作用活化羰基化合物、亚胺化合物、硝基化合物等多种反应物,并且能得到具有较高对映选择性(ee%)和非对映选择性(dr%)的产物[2].例如,Schreiner等[3]发现硫脲类催化剂能大大加快环戊二烯和!,"不饱和羰基化合物之间的Diels-Alder反应速率;Jacobsen等[4]报道了手性尿素及硫脲化合物能催化多种对映选择性反应,包括Strecker反应,aza-Baylis-Hillman反应,
aza-Mannich反应和Pictet-Spengler反应等.同时,
Takemoto等[5]发展了新型的硫脲催化剂用于对映选择性aza-Henry反应及1,3-二羰基化合物和硝基烯烃的Michael反应中.此外,有人报道了手性尿素及硫脲催化剂催化吖内酯的醇解反应,产物的ee%值较高[6,7].
实验研究表明,尿素及硫脲类化合物与羰基化
合物、硝基化合物等反应物之间的氢键相互作用在化学选择性的调控中发挥了重要作用,通过理论方法研究其氢键相互作用对理解反应机理将具有积极
Received:December21,2006;Revised:March29,2007;PublishedonWeb:May10,2007.
Englisheditionavailableonlineatwww.sciencedirect.com*
Correspondingauthor.Email:fuyao@ustc.edu.cn;Tel:+86551-3607476.国家自然科学基金(20602034)资助项目
!EditorialofficeofActaPhysico-ChimicaSinica
No.7郑文锐等:尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
1019
键键能(即键生成焓)时运用MP2/6-31+G(d,p)的方法并用Boys和Bernardi的完全均衡校正(counter-
poiseprocedure)[8]消除基组重叠误差(BSSE).在MP2/6-31+G(d,p)水平上进行自然键轨道(NBO)[9]分析.全
部计算均用Gaussian03程序包[10]完成.
2
2.1
图1
尿素和硫脲活化羰基化合物过程
结果与讨论
非取代尿素和硫脲与羰基化合物间氢键作用先讨论非取代尿素及硫脲与羰基化合物之间的
Fig.1
Carbonylactivationbyaureaor
thioureacatalyst
氢键作用及其基本结构.图2为尿素和硫脲与甲醛,丙酮,乙酸甲酯,N,N-二甲基乙酰胺,苯甲醛,苯乙酮及乙醛等羰基化合物之间形成的氢键复合物的构型.比较羰基化合物羰基平面与尿素(硫脲)骨架共面或垂直两种可能构型可知,尿素与丙酮、乙酸甲酯、
X=OorS,LorL′=alargegroup,SorS′=asmallgroup
意义,有助于设计性能更好的尿素及硫脲类催化剂.目前虽然已经提出一些反应机理来解释实验现象[3-5],但是有关尿素及硫脲催化的基本问题仍然没有得到很好的解释.以羰基化合物为例,普遍认为尿素及硫脲与羰基化合物之间是通过形成双氢键复合物来活化反应物的(图1).根据取代基大小相对位置的不同氢键复合物具有两种可能的异构体(顺式cis和反式
N,N-二甲基乙酰胺、苯乙酮及乙醛之间形成的氢键
复合物羰基化合物的羰基平面与尿素骨架近乎垂直,其余几种复合物羰基平面与尿素骨架几乎在同一平面上.硫脲与乙酸甲酯、苯N,N-二甲基乙酰胺、乙酮之间形成的复合物中,羰基平面与硫脲骨架近乎垂直的构型较稳定,其余几种氢键复合物则是羰基平面与硫脲骨架近乎共面的构型较稳定.由图2
trans),提出这个概念有利于理解反应机理及产物的
对映及非对映选择性.
如果顺式和反式复合物之间的稳定性差别较大,则氢键复合物主要以一种构象存在,并受到亲核试剂的进攻,由于空间位阻的影响将可能产生两种进攻方式,得到两种结构的过渡态;如果两种构象稳定性差别很小,则顺反式构象异构体将同时受到亲核试剂的进攻,得到四种不同结构的过渡态.这四种可能过渡态的相对能垒高度决定了总反应的ee%和dr%值.在本文中,我们利用二级微扰理论MP2方法研究了气态常温常压条件下尿素及硫脲类化合物与不同种羰基化合物的氢键作用及氢键复合物的顺反异构现象,通过调节具有不同电子效应和空间效应的取代基,探讨取代基的电子效应和空间效应对氢键强弱及氢键复合物顺反异构的影响.
1计算方法
运用B3LYP/6-31G(d)方法对单体和氢键复合
物进行结构优化,比较多种可能的构象,对稳定点构象的几何构型进行谐振子振动频率分析,得到的振动频率无虚频,表明所有优化的几何构型均为势能面上的极小值点,同时得到热力学校正值(TCE).单点能(SP)的计算运用MP2/6-31+G(d,p)方法,计算氢
图2
尿素和硫脲与不同羰基化合物氢键复合物构型
Fig.2Conformationsofhydrogenbonding
complexesofureaorthioureawithdifferentcarbonylcompounds
1020
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
Vol.23
可以看出,尿素和硫脲与这几种典型的羰基化合物都能形成较强的双氢键,氢键键长H…O在0.209-
动频率为3539.2cm-1,红移了22.9cm-1,N—H键键长增加到0.1015和0.1016nm.
表1列出了经自然键轨道集居分析所得的尿素和硫脲与这几种羰基化合物形成的氢键复合物构型的电子供体(donor)轨道i与电子受体(acceptor)轨道
0.237nm之间,而且该氢键具有典型氢键的特征[11].
例如,形成氢键前,尿素单体质子给体N—H键键长
0.1013nm,N—H键对称伸缩振动频率为3562.1cm-1;与N,N-二甲基乙酰胺形成氢键后,对称伸缩振
表1
j之间的二阶相互作用稳定化能E(2)及氢键键能!E.
氢键复合物的二阶相互作用稳定化能E(2)及氢键键能(!E)的自然轨道分析结果
Table1
Complex1U
TheNBOsecond-orderinteractionenergies(E(2))andhydrogenbondingenergies(!E)of
hydrogenbondingcomplexes
Naturalcharge(e)N(1)-0.97973H(2)0.44068N(3)-0.97966H(4)0.44072O(5)-0.64499C(6)0.35201N(1)-0.98232H(2)0.44058N(3)-0.98521H(4)0.44077O(5)-0.69931C(6)0.70198N(1)-0.98410H(2)0.44188N(3)-0.98404H(4)0.44225O(5)-0.76263C(6)1.00130N(1)-0.98583H(2)0.44610N(3)-0.98893H(4)0.44766O(5)-0.79997C(6)0.85897N(1)-0.98090H(2)0.44589N(3)-0.97843H(4)0.44011O(5)-0.68838C(6)0.53955N(1)-0.98371H(2)0.44171N(3)-0.98351H(4)0.44149O(5)-0.71055C(6)0.70440N(1)-0.98203H(2)0.43482N(3)-0.98736H(4)0.44211O(5)-0.67569C(6)0.52390N(1)-0.93687H(2)0.44840N(3)-0.93680H(4)0.44832O(5)-0.65653C(6)0.36064N(1)-0.93809H(2)0.45323N(3)-0.93798H(4)0.45341O(5)-0.70891C(6)0.71284
DonorNBO(i)LP(1)O5
LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5BD(2)O5-C6LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5LP(1)O5LP(1)O5LP(2)O5LP(2)O5
AcceptorNBO(j)BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2
*
・E(2)/(kJmol-1)
・ΔE/(kJmol-1)
-13.5
12.312.35.45.3
-19.7
7.37.011.38.2
-19.3
13.012.74.94.6
-29.4
12.211.115.38.6
-16.9
14.912.710.02.8
-20.6
8.38.59.29.6
-16.4
6.917.43.74.5
-16.5
17.117.07.37.1
-23.2
20.220.28.99.0
2U
3U
4U
5U
BD(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4
*
6U
BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N1—H2BD(1)N1—H2BD*(1)N3—H4
*
7U
1T
BD*(1)N1-H2BD*(1)N3—H4BD(1)N3—H4BD*(1)N1—H2BD*(1)N3—H4BD*(1)N1—H2
*
2T
tobecontinued
No.7
ContinuedTable1
郑文锐等:尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
1021
(2)H(2)0.44903LP(1)O5BD*(1)N3—H415.5N(3)-0.94087LP(1)O5BD*(1)N1—H215.2H(4)0.44942LP(2)O5BD*(1)N3—H45.1
*
4.8O(5)-0.76803LP(2)O5BD(1)N1—H2
C(6)1.00478
4TN(1)-0.94063-34.2
H(2)0.45516LP(1)O5BD*(1)N3—H414.5N(3)-0.94584LP(1)O5BD*(1)N1—H214.7H(4)0.45503LP(2)O5BD*(1)N3—H417.8
*
O(5)-0.80647BD(2)O5-C6BD(1)N1—H29.9C(6)0.86023
5TN(1)-0.93681-20.7
*
—H(2)0.45406LP(1)O5BD(1)N1H219.4
N(3)-0.93659LP(1)O5BD*(1)N3—H419.2
*
H(4)0.44956LP(2)O5BD(1)N1—H213.2O(5)-0.70219LP(2)O5BD*(1)N3—H44.22C(6)0.54732
6TN(1)-0.93720-24.0
*
H(2)0.44897LP(1)O5BD(1)N3—H411.3N(3)-0.94262LP(1)O5BD*(1)N1—H210.2
*
15.1H(4)0.44989LP(2)O5BD(1)N3—H4
O(5)-0.71761BD(2)O5-C6BD*(1)N1—H26.5C(6)0.70818
7TN(1)-0.93824
H(2)0.45112LP(1)O5BD*(1)N3—H418.8-20.0N(3)-0.93714LP(1)O5BD*(1)N1—H219.3H(4)0.45181LP(2)O5BD*(1)N3—H47.6
*
—O(5)-0.68686LP(2)O5BD(1)N1H29.0
C(6)0.54585
ThenumbersforthecompoundsandatomsarethesameasinFig.2.BD*denotesantibondingorbital,LPdenoteslone-pair.
BD*(1)denotes"orbital,BD*(2)denotes!orbital.LP(1)andLP(2)denotethefirstandthesecondlonepairelectrons,respectively.
稳定化能E(2)越大,表示i与j的相互作用越强,即i提供电子给j的倾向越大.氢键相互作用部分原子的自然电荷也列入表中,化合物及原子编号与图2中保持一致.单体的自然电荷未列出.
从氢键键能数据可以看出,硫脲与羰基化合物之间的氢键作用强于尿素,这是因为硫脲的供质子能力强于尿素,硫脲与尿素的pKa分别为21.0和
子受体氧原子的净电荷减小.如形成氢键前单体尿素的质子给体N—H键上氢原子的净电荷分别为
26.9[12].尿素与硫脲和N,N-二甲基乙酰胺之间的氢键
最强,可见,羰基化合物羰基碳原子上的取代基对氢键强弱有较大的影响,具有给电子诱导效应的取代基有利于氢键的形成,另外,N,N-二甲基氨基上的氮原子和甲氧基上的氧原子的孤对电子与羰基之间还存在p-!共轭作用,使得羰基氧原子上的电子密度增加,接受质子的能力增强,因此氢键容易形成,而且,共轭基团如苯环,能与羰基形成!-!共轭,其相应的羰基化合物与尿素(硫脲)形成的氢键作用也较强,另外,相比于甲基,甲氧基等取代基同时还具有较大的空间位阻效应,但共轭效应的影响比空间效应的影响大.键能强弱顺序与氢键键长的变化顺序是一致的.
由自然键轨道自然电荷布居分析可知,与单体相比,质子给体N—H键上氢原子的净电荷增加,质
0.42456e和0.42465e,羰基化合物甲醛的质子受体氧原子的净电荷为-0.59878e,形成1U后则分别变为0.44068e,0.44072e和-0.64499e.对于其它氢键复合物,电荷变化的规律相同.两单体临近的原子自然电荷变化较大,羰基化合物与形成氢键前相比,净电荷增加,电子是由羰基化合物单体向尿素或硫脲
单体传递,氢键越强,电荷的转移量越大,单体临近原子的自然电荷变化也越大.例如,化合物1U,形成氢键后羰基化合物甲醛部分的总电荷(将复合物中羰基化合物所有原子的净电荷相加得到)为0.00811e,电子由甲醛向尿素转移的净电荷数为0.00811e,化合物1T,形成氢键后甲醛部分的总电荷为0.01186e,电子由甲醛向硫脲转移的净电荷数为0.01186e.表中列出二阶稳定化能较大的几项,氢键复合物的分子间作用主要发生在羰基氧原子的两对孤对电子与相近的N(1)—H(2)和N(3)—H(4)的"*反键轨道之间,对于部分氢键化合物,羰基!轨道电子与N—H反键轨道之间还存在较微弱的相互作用.对于氢键键能较大的复合物,羰基氧原子的孤对电子与N—
H键间的二阶相互作用稳定化能也相对较强,进一
1022
表2
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
取代硫脲与N,N-二甲基乙酰胺氢键复合物的氢键键能
Vol.23
电子密度以及羰基最低未占有轨道"*的能量,从而活化羰基以利于亲核试剂的进攻,氢键强则更有利于亲核试剂进攻羰基.
由图1知,对于具有羰基化合物的羰基平面与尿素(硫脲)骨架接近垂直的构型的氢键复合物,在空间位置上不存在顺反异构的可能,而对于羰基平面与尿素(硫脲)骨架几乎在同一平面的构型,可能会存在空间上的顺反异构.因此,表3和表4分别列出了尿素与苯甲醛,硫脲与乙醛在不同取代基条件下可能存在的顺反式异构体的氢键键能,用!E(cis)和
Table2ThehydrogenbondingenergiesofsubstitutedthioureaswithN,N-dimethylacetamide
R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)
-33.5-31.9
-53.2-35.5
!E(trans)表示,同时用!E(cis)-!E(trans)来表示顺反
异构体构象之间1的稳定性差.单位均为kJ・mol-1.由
于只有尿素和硫脲两个氮原子上取代基不一致的条件下才存在空间位置上的顺反异构,且为了简化计
—CF3-58.2-57.7
算,此处取代基R仅取代一个氮原子上的氢.
从表3和表4看出,对于具有不同电子效应和空间效应取代基的单取代尿素及硫脲,氢键键能的变化规律与前面讨论的双取代硫脲的变化规律是一致的.尿素和硫脲分别与苯甲醛、乙醛形成的氢键复合物顺反异构体之间的能量差在-3.4-0.0kJ・mol-1
表3
尿素与苯甲醛氢键复合物键能及顺反异构键能差
步揭示了该类氢键的本质.
2.2取代硫脲与羰基化合物间氢键作用及氢键复合物的顺反异构
表2列出了具有较强氢键作用的取代硫脲与
N,N-二甲基乙酰胺之间的氢键键能.在2.1节得到
的结构基础上,通过改变硫脲中氮原子上的取代基,得到不同取代基条件下的氢键键能.R为甲基和苯基时,硫脲与N,N-二甲基乙酰胺形成的氢键复合物羰基化合物的羰基平面与硫脲骨架近乎垂直.从键能的相对大小可以看出,硫脲氮原子上的取代基对氢键键能有较大的影响,具有强吸电子诱导效应的取代基如三氟甲基能很大程度上增加氢键强度,而如甲基等供电子取代基氢键作用较弱,共轭取代基苯基也有利于氢键的形成,这是由于具有吸电子诱
导效应以及能与氮原子形成共轭作用的基团均能稳定氮原子上的负电荷,质子供体氮氢键的酸性增加,氢键容易生成.另外,苯基、五氟苯基、!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基还具有较强的空间位阻效应,但可以看出,空间效应对氢键强弱的影响不及电子效应和共轭效应的影响大.对于尿素,取代基的这种变化规律是一致的.!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基为文献中报道的常用的硫脲和尿素催化剂的取代基团,3,5-三氟甲基苯基取代硫脲与羰基化合物形成的氢键作用较强.形成氢键的强弱直接影响亲核试剂对羰基的进攻,尿素和硫脲可视为
Table3Thehydrogenbondingenergiesandcis-
transenergygaps(unitinkJ・mol-1)ofurea/
benzaldehydecomplexes
R—CH3
ΔE(cis)-15.2
ΔE(trans)-15.1
ΔE(cis)-ΔE(trans)
-0.1
-27.5-26.8-0.7
—CF3-29.9-26.1
-28.5-23.4
-1.4-2.7
-12.6-10.6-2.0
Lewis酸,羰基氧原子上的孤对电子可视为Lewis
碱中心,与Lewis酸结合能够大大降低氧原子上的
-33.7-31.5-2.2
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表2
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
取代硫脲与N,N-二甲基乙酰胺氢键复合物的氢键键能
Vol.23
电子密度以及羰基最低未占有轨道"*的能量,从而活化羰基以利于亲核试剂的进攻,氢键强则更有利于亲核试剂进攻羰基.
由图1知,对于具有羰基化合物的羰基平面与尿素(硫脲)骨架接近垂直的构型的氢键复合物,在空间位置上不存在顺反异构的可能,而对于羰基平面与尿素(硫脲)骨架几乎在同一平面的构型,可能会存在空间上的顺反异构.因此,表3和表4分别列出了尿素与苯甲醛,硫脲与乙醛在不同取代基条件下可能存在的顺反式异构体的氢键键能,用!E(cis)和
Table2ThehydrogenbondingenergiesofsubstitutedthioureaswithN,N-dimethylacetamide
R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)R—CH3
・ΔE/(kJmol-1)
-33.5-31.9
-53.2-35.5
!E(trans)表示,同时用!E(cis)-!E(trans)来表示顺反
异构体构象之间1的稳定性差.单位均为kJ・mol-1.由
于只有尿素和硫脲两个氮原子上取代基不一致的条件下才存在空间位置上的顺反异构,且为了简化计
—CF3-58.2-57.7
算,此处取代基R仅取代一个氮原子上的氢.
从表3和表4看出,对于具有不同电子效应和空间效应取代基的单取代尿素及硫脲,氢键键能的变化规律与前面讨论的双取代硫脲的变化规律是一致的.尿素和硫脲分别与苯甲醛、乙醛形成的氢键复合物顺反异构体之间的能量差在-3.4-0.0kJ・mol-1
表3
尿素与苯甲醛氢键复合物键能及顺反异构键能差
步揭示了该类氢键的本质.
2.2取代硫脲与羰基化合物间氢键作用及氢键复合物的顺反异构
表2列出了具有较强氢键作用的取代硫脲与
N,N-二甲基乙酰胺之间的氢键键能.在2.1节得到
的结构基础上,通过改变硫脲中氮原子上的取代基,得到不同取代基条件下的氢键键能.R为甲基和苯基时,硫脲与N,N-二甲基乙酰胺形成的氢键复合物羰基化合物的羰基平面与硫脲骨架近乎垂直.从键能的相对大小可以看出,硫脲氮原子上的取代基对氢键键能有较大的影响,具有强吸电子诱导效应的取代基如三氟甲基能很大程度上增加氢键强度,而如甲基等供电子取代基氢键作用较弱,共轭取代基苯基也有利于氢键的形成,这是由于具有吸电子诱
导效应以及能与氮原子形成共轭作用的基团均能稳定氮原子上的负电荷,质子供体氮氢键的酸性增加,氢键容易生成.另外,苯基、五氟苯基、!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基还具有较强的空间位阻效应,但可以看出,空间效应对氢键强弱的影响不及电子效应和共轭效应的影响大.对于尿素,取代基的这种变化规律是一致的.!-氨基环己烷基和3,5-三氟甲基苯基为文献中报道的常用的硫脲和尿素催化剂的取代基团,3,5-三氟甲基苯基取代硫脲与羰基化合物形成的氢键作用较强.形成氢键的强弱直接影响亲核试剂对羰基的进攻,尿素和硫脲可视为
Table3Thehydrogenbondingenergiesandcis-
transenergygaps(unitinkJ・mol-1)ofurea/
benzaldehydecomplexes
R—CH3
ΔE(cis)-15.2
ΔE(trans)-15.1
ΔE(cis)-ΔE(trans)
-0.1
-27.5-26.8-0.7
—CF3-29.9-26.1
-28.5-23.4
-1.4-2.7
-12.6-10.6-2.0
Lewis酸,羰基氧原子上的孤对电子可视为Lewis
碱中心,与Lewis酸结合能够大大降低氧原子上的
-33.7-31.5-2.2
No.7
表4
郑文锐等:尿素及硫脲与羰基化合物间的氢键相互作用
硫脲与乙醛氢键复合物键能及顺反异构键能差
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Table4Thehydrogenbondingenergiesandcis-transenergygaps(unitinkJ・mol-1)ofthiourea/
acetaldehydecomplexes
R—CH3
ΔE(cis)-19.4
ΔE(trans)-19.4
ΔE(cis)-ΔE(trans)
0.0
-26.9-26.7-0.2
—CF3-29.7-23.6
-28.8-20.2
-0.9-3.4
图3表3中R为苯基时顺反异构体的结构及二阶相互
作用稳定化能
-20.6-20.0-0.6
Fig.3cis-transconformationsandsecond-order
interactionenergiesofhydrogenbondingcomplexes
inTable3whenRisphenyl
-29.1-27.4-1.7
相条件下尿素和硫脲与羰基化合物形成顺反异构氢键复合物的反应,根据热力学循环,表中的!E(cis)-
之间,差别较小且顺式结构较反式稳定.在HF/6-
!E(trans)表示顺反式异构体之间的焓值差!H.由热力学函数关系式!H=!U+!(pV),知内能差!U的范
围也在-3.4-0.0kJ・mol-1之间,由统计热力学最概然分布Ncis/Ntrans=e-!U/RT,Ncis和Ntrans分别表示顺反式异构体的微观粒子数目,可以计算出在298.15K气相常压条件下,Ncis/Ntrans的范围在1.0-3.9之间.因此,尿素和硫脲与羰基化合物形成的氢键复合物顺反式异构体同时存在,两者之间的平衡决定总反应的ee%和dr%值.
31+G(d,p)水平下用NBO¥del删除特定轨道的方法
来分析表3中R为苯基的情形(考虑到NBO¥del只能用于SCF的方法分析),顺式结构较反式结构稳定了
・11.4kJmol-1,图3为这两种异构体的结构,同时也列
出了电子供体轨道i与电子受体轨道j之间的二阶相互作用稳定化能E(2),对顺式复合物删除LP(1)O11与反键轨道BD*(1)N7—H20以及LP(2)O11与反键轨道
BD*(1)N10—H19之间的轨道相互作用,对反式复合物删除LP(1)O11与反键轨道BD*(1)N7—H19以及LP(2)O11与反键轨道BD*(1)N9—H20之间的轨道相互作用,由NBO¥del分析结果得出,顺式复合物的能量与删除之前比,能量增加了29.7kJ・mol-1,反式复合物的能量与删除之前比,能量增加了24.7kJ・mol-1,可以看出,顺式较反式稳定的本质原因来自于顺式结构中羰基氧原子孤对电子轨道LP(1)O11与反键轨道BD*(1)N7—H20以及孤对电子轨道LP(2)O11与反键轨道BD*(1)N10—H19之间的轨道相互
作用,且能量变化的大小规律与二阶相互作用稳定化能大小的规律是一致的.
用A+B→ABcis和A+B#ABtrans来分别表示气
3结论
利用二级微扰理论MP2方法研究了气态常温常压条件下尿素及硫脲类化合物与不同种羰基化合物之间的氢键作用以及氢键复合物的顺反异构现象,讨论了取代基的电子效应和空间效应对氢键强弱及氢键复合物顺反异构的影响.结果表明,尿素和硫脲类化合物与羰基化合物之间能形成具有典型氢键特征的双氢键,质子供体N—H键键长在形成氢键后增加,其伸缩振动频率也相应地发生红移.羰基化合物中具有供电子诱导效应的取代基以及能与羰基形成共轭作用的取代基均使得羰基氧原子的电子密度增加,有利于氢键的形成,而尿素和硫脲中的强吸电
1024
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007
2003,125:12672
Vol.23
子诱导效应取代基以及能与氮原子形成共轭作用的取代基能增加其供质子能力,形成的氢键越强,同时尿素和硫脲中的取代基的空间位阻效应对氢键强弱的影响程度不大.由自然键轨道分析揭示了氢键相互作用的本质,形成氢键后羰基化合物单体带正电荷,羰基氧原子的净电荷减小,电子是由羰基化合物单体对尿素和硫脲类化合物单体传递.氢键复合物的分子间作用主要是发生在羰基氧原子的孤对电子和相近的N—H!*反键轨道之间.通过调节尿素和硫脲具有不同电子效应和空间效应的取代基发现,氢键复合物的顺反异构体能量差别较小,两种异构体同时共存,因此对于尿素及硫脲与羰基化合物的催化反应过程,需要同时对四种不同结构的过渡态进行研究.
References
1
(a)Kelly,T.R.;Kim,M.H.J.Am.Chem.Soc.,1994,116:7072(b)Wilcox,C.S.;Kim,E.;Romano,D.;Kuo,L.H.;Burt,A.L.;Curran,D.P.Tetrahedron,1995,51:621
(c)Linton,B.R.;Goodman,M.S.;Hamilton,A.D.Chem.Eur.J.,2000,6:2449234
(a)Dalko,P.I.;Moisan,L.Angew.Chem.Int.Ed.,2004,43:5138(b)Takemoto,Y.Org.Biomol.Chem.,2005,3:4299(a)Schreiner,P.R.;Wittkopp,A.Org.Lett.,2002,4:217(b)Wittkopp,A.;Schreiner,P.R.Chem.Eur.J.,2003,9:407(a)Sigman,M.S.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,1998,120:4901
(b)Sigman,M.S.;Vachal,P.;Jacobsen,E.N.Angew.Chem.Int.Ed.,2000,39:1279
(c)Vachal,P.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2002,124:10012
(d)Vachal,P.;Jacobsen,E.N.Org.Lett.,2000,2:867
(e)Su,J.T.;Vachal,P.;Jacobsen,E.N.Adv.Synth.Catal.,2001,343:197
(f)Wenzel,A.G.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2002,124:12964
(g)Wenzel,A.G.;Lalonde,M.P.;Jacobsen,E.N.Synlett,2003:1919
(h)Joly,G.D.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2004,126:4102
(i)Taylor,M.S.;Jacobsen,E.N.J.Am.Chem.Soc.,2004,126:10558
(j)Taylor,M.S.;Tokunaga,N.;Jacobsen,E.N.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:6700
(k)Raheem,I.T.;Jacobsen,E.N.Adv.Synth.Catal.,2005,347:17015
(a)Okino,T.;Hoashi,Y.;Takemoto,Y.TetrahedronLett.,2003,44:2817
(b)Okino,T.;Hoashi,Y.;Takemoto,Y.J.Am.Chem.Soc.,
76
(c)Okino,T.;Nakamura,S.;Furukawa,T.;Takemoto,Y.Org.Lett.,2004,6:625
(d)Hoashi,Y.;Yabuta,T.;Takemoto,Y.TetrahedronLett.,2004,45:9185
(e)Okino,T.;Hoashi,Y.;Furukawa,T.;Xu,X.;Takemoto,Y.J.Am.Chem.Soc.,2005,127:119
(f)Hoashi,Y.;Okino,T.;Takemoto,Y.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:4032
(g)Hoashi,Y.;Yabuta,T.;Yuan,P.;Miyabe,H.;Takemoto,Y.Tetrahedron,2005,62:365
(h)Xu,X.;Yabuta,T.;Yuan,P.;Takemoto,Y.Synlett,2006:137(i)Xu,X.;Furukawa,T.;Okino,T.;Miyabe,H.;Takemoto,Y.Chem.Eur.J.,2006,12:466
(a)Berkessel,A.;Cleemann,F.;Mukherjee,S.;Mueller,T.N.;Lex,J.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:807
(b)Berkessel,A.;Mukherjee,S.;Cleemann,F.;Mueller,T.N.;Lex,J.Chem.Commun.,2005:1898
(a)Curran,D.P.;Kuo,L.H.J.Org.Chem.,1994,59:3259(b)Curran,D.P.;Kuo,L.H.TetrahedronLett.,1995,36:6647(c)Sohtome,Y.;Tanatani,A.;Hashimoto,Y.;Nagasawa,K.Chem.Pharm.Bull.,2004,52:477
(d)Dessole,G.;Herrera,R.P.;Ricci,A.Synlett,2004:2374(e)Sohtome,Y.;Tanatani,A.;Hashimoto,Y.;Nagasawa,K.TetrahedronLett.,2004,45:5589
(f)Li,B.J.;Jiang,L.;Liu,M.;Chen,Y.C.;Ding,L.S.;Wu,Y.Synlett,2005:603
(g)Vakulva,B.;Varga,S.;Csampai,A.;Soos,T.Org.Lett.,2005,7:1967
(h)Wang,J.;Li,H.;Yu,X.;Zu,L.;Wang,W.Org.Lett.,2005,7:4293
(i)Wang,J.;Li,H.;Duan,W.;Zu,L.;Wang,W.Org.Lett.,2005,7:4713
(j)Dove,A.P.;Pratt,R.C.;Lohmeijer,B.G.G.;Waymouth,R.M.;Hedrick,J.L.J.Am.Chem.Soc.,2005,127:13798(k)McCooey,S.H.;Connon,S.J.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:6367
(l)Herrera,R.P.;Sgarzani,V.;Bernardi,L.;Ricci,A.Angew.Chem.Int.Ed.,2005,44:6576
(m)Sohtome,Y.;Hashimoto,Y.;Nagasawa,K.Adv.Synth.Catal.,2005,347:1643
(n)Tsogoeva,S.B.;Yalalov,D.A.;Hateley,M.J.;Weckbecker,C.;Huthmacher,K.Eur.J.Org.Chem.,2005:49958Boys,S.F.;Bernardi,F.Mol.Phys.,1970,19:553
9Reed,A.E.;Curtiss,L.A.;Weinhold,F.Chem.Rev.,1988,88:899101112
Frisch,M.J.;Trucks,G.W.;Schlegel,H.B.;etal.Gaussian03,RevisionA.1.PittsburghPA:GaussianInc.,2003
Li,Q.;Huang,F.Q.Acta.Phys.-Chim.Sin.,2005,21(1):52[李
权,黄方千.物理化学学报,2005,21(1):52]
Bordwell,F.G.;Algrim,D.J.;Harrelson,Jr.J.A.J.Am.Chem.Soc.,1988,110:5903